“A comissão pedagógica é o órgão científico-pedagógico de direção estratégica, coordenação, supervisão e acompanhamento do plano de formação e do plano de atividades do CFAE.”
(n.º 1, do artigo 12.º, do Decreto-Lei n.º 127/2015, de 7 de julho)
 
Constituição
 
Dr. Rui dos Anjos Domingues Velho
Diretor do CFAE (Presidente)
 
Conselho de Diretores
Dr. António Carlos Pereira Baptista
Diretor do Agrupamento de Escolas Guilherme Correia Carvalho, Seia (Vice-presidente)
Dr. Manuel António de Almeida Portugal
Diretor do Agrupamento Escolas de Celorico da Beira
Dr. Artur Francisco Almeida de Oliveira
Diretor do Agrupamento de Escolas de Fornos de Algodres
Dr. Joaquim Alexandre Borges Teófilo Loureiro
Diretor do Agrupamento de Escolas de Gouveia
Dr. Luís Filipe Branco Lopes
Diretor do Agrupamento de Escolas de Meda
Doutora Sandra Maria Oliveira Ferrão Lopes
Diretora do Agrupamento de Escolas de Seia
Dr. Armando Jorge Gonçalves de Almeida Neves
Diretor do Agrupamento de Escolas de Trancoso
Dra. Maria Elisabete da Silva Bárbara
Diretora do Agrupamento de Escolas Padre José Augusto da Fonseca, Aguiar da Beira
 
Secção de formação e monitorização
Dr. Horácio Marques dos Santos
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas Guilherme Correia de Carvalho, Seia
Dr.ª Maria Gentil Palavras Paulo Barroso
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Celorico da Beira
Dr. Marco Helder Calçada Fernandes
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Fornos de Algodres
Dr. Rui Manuel de Jesus Gonçalves
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Gouveia
Dr.ª Ana Maria Marcos Moura Pereira
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Meda
Doutora Maria Margarida Cardoso Africano Fernandes Amaral 
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Seia
Dr.ª Inês Catarina Pacheco Augusto
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas de Trancoso
Dr. José Armando da Silva de Gouveia e Sousa
Responsável do Plano de Formação do Agrupamento de Escolas Padre José Augusto da Fonseca, Aguiar da Beira